Identificação de Genes Associados à Agressividade do Câncer Testicular
DOI:
https://doi.org/10.32635/2176-9745.RBC.2024v70n2.4553Palavras-chave:
Neoplasias Testiculares, Células Germinativas, Biologia Computacional/estatística & dados numéricos, PrognósticoResumo
Introdução: Os tumores de células germinativas testiculares representam cerca de 97% dos cânceres testiculares. Histologicamente, classificam-se em seminomas e não seminomas, tendo aplicabilidade diagnóstica e prognóstica. O sucesso terapêutico depende do diagnóstico precoce associado ao correto estadiamento, sendo então de grande importância a avaliação de biomarcadores que possam contribuir para o manejo dessa doença. Objetivo: Identificar os genes que podem estar correlacionados com o prognóstico e a sobrevida no câncer testicular. Método: Análise de bioinformática utilizando 137 amostras de câncer testicular do The Cancer Genome Atlas e 165 amostras de tecido testicular normal do The Genotype-Tissue Expression. A identificação dos genes e análises subsequentes foram feitas pelo GEPIA2. Resultados: Inicialmente avaliou-se, em relação à expressão gênica, os 500 genes mais associados com a sobrevida global do câncer testicular e os 500 com a sobrevida livre de doença. Em seguida, foi realizada a sobreposição dessas duas listas e construído um diagrama de Venn mostrando os 13 genes em comum. Destes, mantiveram-se apenas os codificadores de proteína, verificando quais diferiram significativamente do tecido normal em relação à expressão gênica. Somente ATP10A, SAMD14 e PCAL4 mostraram diferença com significância estatística, todos subexpressos no câncer testicular. A análise deles em conjunto foi ainda mais significativa para a sobrevida global e livre de doença. Conclusão: Foram identificados nesta análise in silico três genes que demonstraram associação significativa de sua expressão com a sobrevida e o prognóstico dos pacientes com câncer testicular.
Downloads
Referências
Baird DC, Meyers GJ, Hu JS. Testicular cancer: diagnosis and treatment. Am Fam Physician. 2018;97(4):261-8.
Smith ZL, Werntz RP, Eggener SE. Testicular cancer. Med Clin North Am. 2018;102(2):251-64. doi: https://doi.org/10.1016/j.mcna.2017.10.003 DOI: https://doi.org/10.1016/j.mcna.2017.10.003
Teng LK, Pereira BA, Keerthikumar S, et al. Mast Cell-Derived SAMD14 is a novel regulator of the human prostate tumor microenvironment. Cancers. 2021;13(6):1237. doi: https://doi.org/10.3390/cancers13061237 DOI: https://doi.org/10.3390/cancers13061237
Miller KD, Nogueira L, Mariotto AB, et al. Cancer treatment and survivorship statistics, 2019. CA. 2019;69(5):363-85. doi: https://doi.org/10.3322/caac.21565 DOI: https://doi.org/10.3322/caac.21565
Mourão TC, Curado MP, Oliveira RAR, et al. Epidemiology of urological cancers in Brazil: trends in mortality rates over more than two decades. J Epidemiol Glob Health 2022;12(3):239-47. doi: https://doi.org/10.1007/s44197-022-00042-8 DOI: https://doi.org/10.1007/s44197-022-00042-8
Kliesch S, Schmidt S, Wilborn D et al. Management of germ cell tumours of the testis in adult patients. german clinical practice guideline part i: epidemiology, classification, diagnosis, prognosis, fertility preservation, and treatment recommendations for localized stages. Urol Int. 2021;105(3-4):1-12. doi: https://doi.org/10.1159/000510407 DOI: https://doi.org/10.1159/000510407
Yang J, Yang Q. Identification of core genes and screening of potential targets in glioblastoma multiforme by integrated bioinformatic analysis. Front Oncol. 2021;10(615976):1-12. doi: https://doi.org/10.3389/fonc.2020.615976 DOI: https://doi.org/10.3389/fonc.2020.615976
Souza KW, Reis PE, Gomes IP, et al. Estratégias de prevenção para câncer de testículo e pênis: revisão integrativa. Rev Esc Enferm USP. 2011;45(1):277-82. doi: https://doi.org/10.1590/s0080-62342011000100039 DOI: https://doi.org/10.1590/S0080-62342011000100039
Leão R, Ahmad AE, Hamilton RJ. Testicular cancer biomarkers: a role for precision medicine in testicular cancer. Clin Genitourin Cancer. 2019;17(1):e176-83. doi: https://doi.org/10.1016/j.clgc.2018.10.007 DOI: https://doi.org/10.1016/j.clgc.2018.10.007
Nacional Cancer Institute, Center for Cancer Genomics [Internet]. Annapolis: NIH; 2006. The Cancer Genome Atlas (TCGA); 2006. [acesso 2024 mar 8]. Disponível em: https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/tcga
GTEx: The Genotype-Tissue Expression [Internet]. Versão phs000424.v9.p2. Bethesda: NIH; [sem data]. [acesso 2024 mar 8]. Disponível em: https://gtexportal.org/home/
Conselho Nacional de Saúde (BR). Resolução n° 510, de 7 de abril de 2016. Dispõe sobre as normas aplicáveis a pesquisas em Ciências Humanas e Sociais cujos procedimentos metodológicos envolvam a utilização de dados diretamente obtidos com os participantes ou de informações identificáveis ou que possam acarretar riscos maiores do que os existentes na vida cotidiana, na forma definida nesta Resolução [Internet]. Diário Oficial da União, Brasília, DF. 2016 maio 24 [acesso 2024 jan 20]; Seção I:44. Disponível em: http://bvsms.saude.gov.br/bvs/saudelegis/cns/2016/res0510_07_04_2016.html
Tang Z, Kang B, Li C, et al. GEPIA2: an enhanced web server for large-scale expression profiling and interactive analysis. Nucleic Acids Res. 2019;47(W1):W556-60. doi: https://doi.org/10.1093/nar/gkz430 DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkz430
Chandrashekar DS, Karthikeyan SK, Korla PK, et al. UALCAN: uma atualização para a plataforma integrada de análise de dados de câncer. Neoplasia. 2022;25:18-27. doi: https://doi.org/10.1016/j.neo.2022.01.001 DOI: https://doi.org/10.1016/j.neo.2022.01.001
Bruijn I, Kundra R, Mastrogiacomo B, et al. Analysis and visualization of longitudinal genomic and clinical data from the AACR project GENIE Biopharma Collaborative in cBioPortal. Cancer Res. 2023;83(23):3861-7. doi: https://doi.org/10.1158/0008-5472.can-23-0816 DOI: https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-23-0816
WebGestalt [Internet]. Versão 1.2. Houston: Zhang Lab; ©2024. [acesso 2024 mar 8]. Disponível em: http://webgestalt.org/
Toni L, Šabovic I, Cosci I, et al. Testicular cancer: genes, environment, hormones. Front Endocrinol. 2019;10(408):1-11. doi: https://doi.org/10.3389/fendo.2019.00408 DOI: https://doi.org/10.3389/fendo.2019.00408
Boccellino M, Vanacore D, Zappavigna S, et al. Testicular cancer from diagnosis to epigenetic factors. Oncotarget. 2017;8(61):104654-63. doi: https://doi.org/10.18632/oncotarget.20992 DOI: https://doi.org/10.18632/oncotarget.20992
Chieffi P, Franco R, Portella G. Molecular and cell biology of testicular germ cell tumors. Int Rev Cell Mol Biol. 2009;278:277-308. doi: https://doi.org/10.1016/s1937-6448(09)78006-2 DOI: https://doi.org/10.1016/S1937-6448(09)78006-2
Murray MJ, Huddart RA, Coleman N. The present and future of serum diagnostic tests for testicular germ cell tumours. Nat Rev Urol. 2016;13(12):715-25. doi: https://doi.org/10.1038/nrurol.2016.170 DOI: https://doi.org/10.1038/nrurol.2016.170
Nauman M, Leslie SW. Nonseminomatous testicular tumors. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island: StatPearls Publishing; 2023. [acesso 2024 mar 8]. Disponível em: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK568754/
Baylin SB, Jones PA. A decade of exploring the cancer epigenome — biological and translational implications. Nat Rev Cancer. 2011;11(10):726-34. doi: https://doi.org/10.1038/nrc3130 DOI: https://doi.org/10.1038/nrc3130
Chung CC, Kanetsky PA, Wang Z, et al. Meta-analysis identifies four new loci associated with testicular germ cell tumor. Nat Genet. 2013;45(6):680-5. doi: https://doi.org/10.1038/ng.2634 DOI: https://doi.org/10.1038/ng.2634
Xu X, Chang X, Xu Y, et al. SAMD14 promoter methylation is strongly associated with gene expression and poor prognosis in gastric cancer. Int J Clin Oncol. 2020;25(6):1105-14. doi: https://doi.org/10.1007/s10147-020-01647-4 DOI: https://doi.org/10.1007/s10147-020-01647-4
Downloads
Publicado
Como Citar
Edição
Seção
Licença
Os direitos morais e intelectuais dos artigos pertencem aos respectivos autores, que concedem à RBC o direito de publicação.
Este trabalho está licenciado sob uma licença Creative Commons Attribution 4.0 International License.