Vigilância Genômica de Variantes do SARS-CoV-2 em um Hospital Referência para o Tratamento de Câncer no Rio de Janeiro, Brasil

Autores

  • Élida Mendes de Oliveira Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0005-1086-9652
  • Caroline Carvalho de Sá Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0007-9337-7956
  • Julia Botto de Barros Cordeiro Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0005-2199-6534
  • Luiz Claudio Santos Thuler Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Epidemiologia Clínica. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0003-2550-6537
  • Maria Eduarda Lanzillota Assumpção Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0008-4315-3601
  • Gabriela Seara de Andrade Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil.
  • Vinicius Figueiredo Vizzoni Instituto de Pesquisas Biomédicas, Laboratório de Biologia Molecular, Hospital Naval Marcílio Dias. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-7595-1607
  • João Paulo de Biaso Viola Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Imunologia e Biologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. Rio de Janeiro, Brazil https://orcid.org/0000-0002-0698-3146
  • Marcelo Alves Soares Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-9013-2570
  • Juliana Domett Siqueira Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-4266-9795
  • Livia Ramos Goes Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-4909-4912

DOI:

https://doi.org/10.32635/2176-9745.RBC.2024v70n3.4637

Palavras-chave:

SARS-CoV-2, COVID-19, Neoplasms/genetics, Epidemiological Monitoring, Genome, Viral

Resumo

Introdução: A rápida propagação do SARS-CoV-2 e as altas taxas de mutação durante a replicação viral levam à diversificação do vírus e ao surgimento de novas variantes. A vigilância genômica tem sido fundamental para monitorar as variantes do SARS-CoV-2 em todo o mundo. A supressão imunológica, conforme observada em pacientes com câncer, é um fator de risco para infecção por SARS-CoV-2 e covid-19 grave. Objetivo: Relatar uma vigilância genômica de dois anos do SARS-CoV-2 em pacientes com câncer acompanhados no Instituto Nacional de Câncer, Rio de Janeiro, Brasil. Método: Estudo observacional prospectivo. Foi avaliado um total de 384 amostras de swabs SARS-CoV-2+ coletadas entre outubro de 2020 e setembro de 2022. O pico do SARS-CoV-2 foi analisado por PCR e sequenciamento Sanger para determinar a variante infecciosa. Resultados: A maioria dos pacientes apresentava malignidades de órgãos sólidos (298/384; 77,6%) e 16,1% (62/384), doença metastática. Os casos graves de covid-19 representaram 29,4% (113/384) e foram registrados 27,1% (104/384) óbitos. Em relação às variantes infectantes do SARS-CoV-2, as mais comuns foram Gamma (n=137) e Ômicron (BA.1) (n=73). A distribuição da variante ao longo do tempo foi semelhante ao que foi relatado para a população geral do Brasil no mesmo período. Quando analisadas as topografias de câncer dos pacientes, a Gamma infectou pacientes com câncer de mama (47/137; 34,3%) e cervical (11/137; 8%), mais frequentemente do que outras variantes, enquanto a Ômicron predominou entre reto (10/122; 8,2%) e câncer de próstata (8/122; 6,6%) em comparação com outras variantes. Conclusão: A vigilância genômica é uma ferramenta importante para identificar e avaliar o impacto das variantes do SARS-CoV-2, e deve prosseguir especialmente em populações imunossuprimidas.

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Publicado

2024-07-19

Como Citar

1.
Oliveira Élida M de, Sá CC de, Cordeiro JB de B, Thuler LCS, Assumpção MEL, Andrade GS de, Vizzoni VF, Viola JP de B, Soares MA, Siqueira JD, Goes LR. Vigilância Genômica de Variantes do SARS-CoV-2 em um Hospital Referência para o Tratamento de Câncer no Rio de Janeiro, Brasil. Rev. Bras. Cancerol. [Internet]. 19º de julho de 2024 [citado 22º de julho de 2024];70(3):e-094637. Disponível em: https://rbc.inca.gov.br/index.php/revista/article/view/4637

Edição

v. 70 n. 3 (2024): jul./ago./set.

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