Vigilancia Genómica de Variantes del SARS-CoV-2 en un Hospital de Referencia para el Tratamiento del Cáncer en Río de Janeiro, Brasil

Autores/as

  • Élida Mendes de Oliveira Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0005-1086-9652
  • Caroline Carvalho de Sá Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0007-9337-7956
  • Julia Botto de Barros Cordeiro Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0005-2199-6534
  • Luiz Claudio Santos Thuler Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Epidemiologia Clínica. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0003-2550-6537
  • Maria Eduarda Lanzillota Assumpção Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0008-4315-3601
  • Gabriela Seara de Andrade Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil.
  • Vinicius Figueiredo Vizzoni Instituto de Pesquisas Biomédicas, Laboratório de Biologia Molecular, Hospital Naval Marcílio Dias. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-7595-1607
  • João Paulo de Biaso Viola Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Imunologia e Biologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. Rio de Janeiro, Brazil https://orcid.org/0000-0002-0698-3146
  • Marcelo Alves Soares Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-9013-2570
  • Juliana Domett Siqueira Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-4266-9795
  • Livia Ramos Goes Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-4909-4912

DOI:

https://doi.org/10.32635/2176-9745.RBC.2024v70n3.4637

Palabras clave:

SARS-CoV-2, COVID-19, Neoplasias/genética, Monitoreo Epidemiológico, Genoma Viral

Resumen

Introducción: La rápida propagación del SARS-CoV-2 y las altas tasas de mutación durante la replicación viral conducen a la diversificación del virus y la aparición de nuevas variantes. La vigilancia genómica ha sido clave para monitorear las variantes del SARS-CoV-2 en todo el mundo. La inmunosupresión, como se observa en pacientes con cáncer, es un factor de riesgo de infección por SARS-CoV-2 y COVID-19 grave. Objetivo: Informar una vigilancia genómica de dos años del SARS-CoV-2 en pacientes con cáncer seguida en el Instituto Nacional de Cáncer, Río de Janeiro, Brasil. Método: Estudio observacional prospectivo. Se evaluaron un total de 384 muestras de hisopos de SARS-CoV-2+ recolectadas entre octubre de 2020 y septiembre de 2022. El pico de SARS-CoV-2 se analizó mediante PCR y secuenciación Sanger para determinar la variante infectante. Resultados: La mayoría de los pacientes tenían neoplasias malignas de órganos sólidos (298/384; 77,6%) y el 16,1% (62/384), enfermedad metastásica. Los casos graves de COVID-19 representaron el 29,4% (113/384) y se registraron el 27,1% (104/384) de las muertes. En cuanto a las variantes infectantes del SARS-CoV-2, las más comunes fueron Gamma (n=137) y Ómicron (BA.1) (n=73). La distribución de variantes en el tiempo fue similar a lo reportado para la población general del Brasil en el mismo período. Cuando se analizaron las topografías de cáncer de los pacientes, la Gamma infectó a los pacientes con cáncer de mama (47/137; 34,3%) y de cuello uterino (11/137; 8%) con mayor frecuencia que otras variantes, mientras que Ómicron predominó entre el recto (10/122; 8,2%) y cáncer de próstata (8/122; 6,6%) en comparación con otras variantes. Conclusión: La vigilancia genómica es una herramienta importante para identificar y evaluar el impacto de las variantes del SARS-CoV-2 y debe continuarse, especialmente en poblaciones inmunodeprimidas.

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Citas

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Publicado

2024-07-19

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1.
Oliveira ÉM de, Sá CC de, Cordeiro JB de B, Thuler LCS, Assumpção MEL, Andrade GS de, Vizzoni VF, Viola JP de B, Soares MA, Siqueira JD, Goes LR. Vigilancia Genómica de Variantes del SARS-CoV-2 en un Hospital de Referencia para el Tratamiento del Cáncer en Río de Janeiro, Brasil. Rev. Bras. Cancerol. [Internet]. 19 de julio de 2024 [citado 17 de diciembre de 2025];70(3):e-094637. Disponible en: https://rbc.inca.gov.br/index.php/revista/article/view/4637

Número

Vol. 70 Núm. 3 (2024): jul./ago./sept.

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