Vigilancia Genómica de Variantes del SARS-CoV-2 en un Hospital de Referencia para el Tratamiento del Cáncer en Río de Janeiro, Brasil

Autores/as

  • Élida Mendes de Oliveira Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0005-1086-9652
  • Caroline Carvalho de Sá Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0007-9337-7956
  • Julia Botto de Barros Cordeiro Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0005-2199-6534
  • Luiz Claudio Santos Thuler Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Epidemiologia Clínica. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0003-2550-6537
  • Maria Eduarda Lanzillota Assumpção Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0009-0008-4315-3601
  • Gabriela Seara de Andrade Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil.
  • Vinicius Figueiredo Vizzoni Instituto de Pesquisas Biomédicas, Laboratório de Biologia Molecular, Hospital Naval Marcílio Dias. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-7595-1607
  • João Paulo de Biaso Viola Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Imunologia e Biologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. Rio de Janeiro, Brazil https://orcid.org/0000-0002-0698-3146
  • Marcelo Alves Soares Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-9013-2570
  • Juliana Domett Siqueira Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-4266-9795
  • Livia Ramos Goes Instituto Nacional de Câncer (INCA), Programa de Genética e Virologia Tumoral. Rio de Janeiro (RJ), Brasil. https://orcid.org/0000-0002-4909-4912

DOI:

https://doi.org/10.32635/2176-9745.RBC.2024v70n3.4637

Palabras clave:

SARS-CoV-2, COVID-19, Neoplasias/genética, Monitoreo Epidemiológico, Genoma Viral

Resumen

Introducción: La rápida propagación del SARS-CoV-2 y las altas tasas de mutación durante la replicación viral conducen a la diversificación del virus y la aparición de nuevas variantes. La vigilancia genómica ha sido clave para monitorear las variantes del SARS-CoV-2 en todo el mundo. La inmunosupresión, como se observa en pacientes con cáncer, es un factor de riesgo de infección por SARS-CoV-2 y COVID-19 grave. Objetivo: Informar una vigilancia genómica de dos años del SARS-CoV-2 en pacientes con cáncer seguida en el Instituto Nacional de Cáncer, Río de Janeiro, Brasil. Método: Estudio observacional prospectivo. Se evaluaron un total de 384 muestras de hisopos de SARS-CoV-2+ recolectadas entre octubre de 2020 y septiembre de 2022. El pico de SARS-CoV-2 se analizó mediante PCR y secuenciación Sanger para determinar la variante infectante. Resultados: La mayoría de los pacientes tenían neoplasias malignas de órganos sólidos (298/384; 77,6%) y el 16,1% (62/384), enfermedad metastásica. Los casos graves de COVID-19 representaron el 29,4% (113/384) y se registraron el 27,1% (104/384) de las muertes. En cuanto a las variantes infectantes del SARS-CoV-2, las más comunes fueron Gamma (n=137) y Ómicron (BA.1) (n=73). La distribución de variantes en el tiempo fue similar a lo reportado para la población general del Brasil en el mismo período. Cuando se analizaron las topografías de cáncer de los pacientes, la Gamma infectó a los pacientes con cáncer de mama (47/137; 34,3%) y de cuello uterino (11/137; 8%) con mayor frecuencia que otras variantes, mientras que Ómicron predominó entre el recto (10/122; 8,2%) y cáncer de próstata (8/122; 6,6%) en comparación con otras variantes. Conclusión: La vigilancia genómica es una herramienta importante para identificar y evaluar el impacto de las variantes del SARS-CoV-2 y debe continuarse, especialmente en poblaciones inmunodeprimidas.

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Citas

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2024-07-19

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Oliveira Élida M de, Sá CC de, Cordeiro JB de B, Thuler LCS, Assumpção MEL, Andrade GS de, Vizzoni VF, Viola JP de B, Soares MA, Siqueira JD, Goes LR. Vigilancia Genómica de Variantes del SARS-CoV-2 en un Hospital de Referencia para el Tratamiento del Cáncer en Río de Janeiro, Brasil. Rev. Bras. Cancerol. [Internet]. 19 de julio de 2024 [citado 22 de julio de 2024];70(3):e-094637. Disponible en: https://rbc.inca.gov.br/index.php/revista/article/view/4637

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