Vigilancia Genómica de Variantes del SARS-CoV-2 en un Hospital de Referencia para el Tratamiento del Cáncer en Río de Janeiro, Brasil
DOI:
https://doi.org/10.32635/2176-9745.RBC.2024v70n3.4637Palabras clave:
SARS-CoV-2, COVID-19, Neoplasias/genética, Monitoreo Epidemiológico, Genoma ViralResumen
Introducción: La rápida propagación del SARS-CoV-2 y las altas tasas de mutación durante la replicación viral conducen a la diversificación del virus y la aparición de nuevas variantes. La vigilancia genómica ha sido clave para monitorear las variantes del SARS-CoV-2 en todo el mundo. La inmunosupresión, como se observa en pacientes con cáncer, es un factor de riesgo de infección por SARS-CoV-2 y COVID-19 grave. Objetivo: Informar una vigilancia genómica de dos años del SARS-CoV-2 en pacientes con cáncer seguida en el Instituto Nacional de Cáncer, Río de Janeiro, Brasil. Método: Estudio observacional prospectivo. Se evaluaron un total de 384 muestras de hisopos de SARS-CoV-2+ recolectadas entre octubre de 2020 y septiembre de 2022. El pico de SARS-CoV-2 se analizó mediante PCR y secuenciación Sanger para determinar la variante infectante. Resultados: La mayoría de los pacientes tenían neoplasias malignas de órganos sólidos (298/384; 77,6%) y el 16,1% (62/384), enfermedad metastásica. Los casos graves de COVID-19 representaron el 29,4% (113/384) y se registraron el 27,1% (104/384) de las muertes. En cuanto a las variantes infectantes del SARS-CoV-2, las más comunes fueron Gamma (n=137) y Ómicron (BA.1) (n=73). La distribución de variantes en el tiempo fue similar a lo reportado para la población general del Brasil en el mismo período. Cuando se analizaron las topografías de cáncer de los pacientes, la Gamma infectó a los pacientes con cáncer de mama (47/137; 34,3%) y de cuello uterino (11/137; 8%) con mayor frecuencia que otras variantes, mientras que Ómicron predominó entre el recto (10/122; 8,2%) y cáncer de próstata (8/122; 6,6%) en comparación con otras variantes. Conclusión: La vigilancia genómica es una herramienta importante para identificar y evaluar el impacto de las variantes del SARS-CoV-2 y debe continuarse, especialmente en poblaciones inmunodeprimidas.
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